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{rtaxrefdb} : que faire quand mon API préférée a été cyberattaquée ?
1 : Laboratoire des EcoSystèmes et des Sociétés en Montagne
Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement, observatoire des sciences de l'univers de Grenoble, Université Grenoble Alpes
2 : Laboratoire d'Ecologie Alpine
Université Savoie Mont Blanc, Centre National de la Recherche Scientifique, observatoire des sciences de l'univers de Grenoble, Université Grenoble Alpes
| Type : | : | Présentation longue (20 min) |
| Commentaire | : | {rtaxref} est un package R d'accès à l'API du référentiel taxonomique national, TAXREF, du Muséum National d'Histoire Naturelle, une étape essentielle pour le travail impliquant des noms d'espèce en écologie. Ce package est très utilisé pour standardiser les noms d'espèce par rapport à la référence donnée annuellement par TAXREF. À l'été 2026, le Muséum est cyberattaqué, rendant l'API hors-ligne. Fort heureusement, le Muséum partage sur un site de secours les tableaux plats correspondants à la base de données. Nous avons donc développé un nouveau package {rtaxrefdb}, imitant les fonctionnalités de {rtaxref}. Le nouveau package mobilise des fichiers locaux en les intégrant dans une base de données SQL. Cette transcription de fonctionnalités implique de réfléchir aux parallèles entre API et base de données (recherche exacte, correspondance approximative, parallélisation), et à terme, à l'intégration entre les deux packages existants. En outre, nous avons tenté d'appliquer les meilleurs principes de développement pour interagir avec une base de données SQL. Et tout cela, en ayant toujours en tête la facilité et la transparence d'utilisation par un public non averti. |
| Thématiques | : | Bases de données |
| Mots-Clés | : | Package ; API ; SQL ; Taxonomie ; Ecologie ; Ingénieur |
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