12èmes Rencontres R>
Comment le prétraitement des données façonne les conclusions en métagénomique ? Un benchmark reproductible pour guider l'analyse du microbiome
Emile Mardoc  1, @  , Maxence Klock  1  , Xavier Raffoux  1  , Julie Aubert  2  , Christelle Hennequet-Antier  3, 4  , Marie Courbariaux  5  , Mathilde Sola  1  , Emmanuelle Le Chatelier  1  , Nicolas Maziers  1  , Florence Thirion  1  , Florian Plaza Oñate  1  , Giacomo Vitali  1  , Lindsay Goulet  1  , Mahendra Mariadassou  3, 4  , Mathieu Almeida  1  , Magali Berland  6, @  
1 : MetaGenoPolis
Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement
2 : Mathématiques et Informatique Appliquées
AgroParisTech, Université Paris-Saclay, Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement, Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement : UMR0518
3 : MaIAGE
Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement
4 : MIGALE
Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement
5 : Sorbonne Université Maison des Modélisations Ingénieries et Technologies
Sorbonne Université
6 : MetaGenoPolis
Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement
Type : : Poster
Thématiques : Posters
Mots-Clés : Benchmark ; Microbiome intestinal ; Métagénomique shotgun ; Science reproductible ; Prétraitements des données
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